Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR53Q7Z5U6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms