Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MUC6Q6W4X9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MUC6Q6W4X9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms