Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01545Q5VT33 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01545Q5VT33 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 834.7 ms