Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC183Q5T5S1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC183Q5T5S1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC183Q5T5S1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms