Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COBLL1Q53SF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COBLL1Q53SF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms