Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRMT12Q53H54 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRMT12Q53H54 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRMT12Q53H54 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms