Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9B1Q4ZJI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9B1Q4ZJI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9B1Q4ZJI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms