Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
FHOD3Q2V2M9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
FHOD3Q2V2M9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
FHOD3Q2V2M9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FHOD3Q2V2M9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms