Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ME3Q16798 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME3Q16798 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME3Q16798 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ME3Q16798 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ME3Q16798 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ME3Q16798 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ME3Q16798 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ME3Q16798 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ME3Q16798 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ME3Q16798 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ME3Q16798 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ME3Q16798 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ME3Q16798 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ME3Q16798 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ME3Q16798 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ME3Q16798 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ME3Q16798 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ME3Q16798 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ME3Q16798 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ME3Q16798 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ME3Q16798 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ME3Q16798 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ME3Q16798 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ME3Q16798 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ME3Q16798 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ME3Q16798 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ME3Q16798 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ME3Q16798 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ME3Q16798 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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