Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKN3Q16667 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKN3Q16667 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN3Q16667 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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