Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NKX1-1Q15270 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NKX1-1Q15270 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NKX1-1Q15270 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
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