Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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TRAF3Q13114 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF3Q13114 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF3Q13114 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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