Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2AQ12879 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2AQ12879 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
GRIN2AQ12879 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2AQ12879 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
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