Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NFIAQ12857 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NFIAQ12857 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFIAQ12857 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
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