Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC63Q05C16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC63Q05C16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms