Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CDK5Q00535 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDK5Q00535 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms