Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBXN2AP68543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN2AP68543 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBXN2AP68543 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms