Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNRPEP62304 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNRPEP62304 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms