Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCE1P61221 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCE1P61221 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCE1P61221 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms