Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00310P59036 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00310P59036 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms