Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 MRPL30-204ENST00000465432 1752 ntTSL 57.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 MRPL30-201ENST00000338148 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 MRPL30-203ENST00000409841 1497 ntTSL 53.93□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-FNTB-203ENST00000552941 1847 ntTSL 210.92□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-FNTB-201ENST00000549987 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-205ENST00000551947 1521 ntTSL 27.41□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-206ENST00000552002 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-202ENST00000548752 439 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 CHURC1-204ENST00000551093 1023 ntTSL 25.74□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 39.6
SUB1P53999 SF3B3-215ENST00000577085 529 ntTSL 411.67□□□□□ -0.541e-9■■■■■ 39.5
SUB1P53999 SF3B3-207ENST00000566095 453 ntTSL 37.87□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 39.5
SUB1P53999 SF3B3-210ENST00000567654 334 ntTSL 34.47□□□□□ -1.691e-9■■■■■ 39.5
SUB1P53999 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-201ENST00000375549 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-211ENST00000525987 968 ntTSL 49.07□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-213ENST00000532699 571 ntTSL 39.07□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-212ENST00000531744 566 ntTSL 29.07□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-203ENST00000526592 861 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 SDHD-207ENST00000530923 717 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 39.4
SUB1P53999 MRPS18C-208ENST00000512375 2482 ntTSL 28.84□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 39.4
SUB1P53999 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 39.4
SUB1P53999 CAND1-207ENST00000544619 4091 ntTSL 1 (best)1.79□□□□□ -2.122e-7■■■■■ 39.4
SUB1P53999 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 39.4
SUB1P53999 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 39.4
SUB1P53999 DYNLL1-211ENST00000552870 595 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 39.4
SUB1P53999 DYNLL1-202ENST00000392508 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 39.4
SUB1P53999 DYNLL1-210ENST00000552316 670 nt3.95□□□□□ -1.781e-8■■■■■ 39.4
SUB1P53999 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 215.98■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 39.4
SUB1P53999 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-28■■■■■ 39.3
SUB1P53999 COX7A2-208ENST00000509698 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 39.3
SUB1P53999 COX7A2-202ENST00000370089 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 39.3
SUB1P53999 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 39.3
SUB1P53999 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 39.3
SUB1P53999 COX7A2-204ENST00000459637 501 ntTSL 23.15□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 39.3
SUB1P53999 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.522e-7■■■■■ 39.3
SUB1P53999 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 514.23□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 39.2
SUB1P53999 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 39.2
SUB1P53999 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.91e-9■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.24e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.064e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.344e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.484e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.494e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.644e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.694e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 510.72□□□□□ -0.694e-27■■■■■ 39.2
SUB1P53999 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.232e-11■■■■■ 39.2
SUB1P53999 KDM1A-206ENST00000602503 2810 nt6.19□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 39.1
SUB1P53999 CPOX-203ENST00000512905 593 ntTSL 53.52□□□□□ -1.856e-9■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-205ENST00000467117 687 ntTSL 210.14□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-211ENST00000611607 1504 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-212ENST00000618945 1432 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-201ENST00000355749 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-203ENST00000459880 599 ntTSL 27.78□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-204ENST00000466896 778 ntTSL 37.78□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 NDUFA5-202ENST00000378795 1360 ntTSL 22.54□□□□□ -23e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 213.46□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 212□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 511.26□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)8.1□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC6.28□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.457e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.277e-10■■■■■ 39.1
SUB1P53999 AC131235.1-201ENST00000433853 732 ntBASIC7.77□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 39.1
SUB1P53999 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.857e-9■■■■■ 39
SUB1P53999 PAPOLA-220ENST00000556459 959 ntTSL 52.88□□□□□ -1.953e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.13e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 SRPRA-207ENST00000532268 829 ntTSL 27.53□□□□□ -1.25e-29■■■■■ 39
SUB1P53999 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.197e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.67e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.647e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 TYW3-204ENST00000467646 653 ntTSL 1 (best)4.05□□□□□ -1.767e-8■■■■■ 39
SUB1P53999 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 39
SUB1P53999 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 39
SUB1P53999 EBPL-206ENST00000473576 810 ntTSL 219.35■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 39
SUB1P53999 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 39
SUB1P53999 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 39
SUB1P53999 EBPL-207ENST00000495963 1026 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 39
SUB1P53999 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.067e-7■■■■■ 39
Retrieved 100 of 11,644 protein–RNA pairs in 259.1 ms