RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473576.6

EBPL-206, Transcript of EBP like, humanhuman

TSL 2

Gene EBPL, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBPL-206ENST00000473576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.92■■■■■ 7.66
EBPL-206ENST00000473576 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.07■■■■■ 6.57
EBPL-206ENST00000473576 ABCC9O60706 1549 aa55.22■■■■■ 6.43
EBPL-206ENST00000473576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.99■■■■■ 6.07
EBPL-206ENST00000473576 NACADO15069 1562 aa52.88■■■■■ 6.06
EBPL-206ENST00000473576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.76■■■■■ 6.04
EBPL-206ENST00000473576 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.49■■■■■ 5.99
EBPL-206ENST00000473576 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.31■■■■■ 5.96
EBPL-206ENST00000473576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.1■■■■■ 5.93
EBPL-206ENST00000473576 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.66■■■■■ 5.86
EBPL-206ENST00000473576 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.58■■■■■ 5.85
EBPL-206ENST00000473576 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.36■■■■■ 5.81
EBPL-206ENST00000473576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.1■■■■■ 5.77
EBPL-206ENST00000473576 SCRIBQ14160 1630 aa51.05■■■■■ 5.76
EBPL-206ENST00000473576 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.9■■■■■ 5.74
EBPL-206ENST00000473576 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
EBPL-206ENST00000473576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.93■■■■■ 5.58
EBPL-206ENST00000473576 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.7■■■■■ 5.55
EBPL-206ENST00000473576 SMARCA4P51532 1647 aa48.85■■■■■ 5.41
EBPL-206ENST00000473576 NCAPD3P42695 1498 aa48.83■■■■■ 5.41
EBPL-206ENST00000473576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
EBPL-206ENST00000473576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.75■■■■■ 5.4
EBPL-206ENST00000473576 SMARCA2P51531 1590 aa48.68■■■■■ 5.38
EBPL-206ENST00000473576 HMGXB3Q12766 1538 aa48.48■■■■■ 5.35
EBPL-206ENST00000473576 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.44■■■■■ 5.35
EBPL-206ENST00000473576 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.44■■■■■ 5.35
EBPL-206ENST00000473576 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
EBPL-206ENST00000473576 WIZO95785 1651 aa47.86■■■■■ 5.25
EBPL-206ENST00000473576 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
EBPL-206ENST00000473576 ERCC6Q03468 1493 aa47.65■■■■■ 5.22
EBPL-206ENST00000473576 NESP48681 1621 aa47.65■■■■■ 5.22
EBPL-206ENST00000473576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.54■■■■■ 5.2
EBPL-206ENST00000473576 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.39■■■■■ 5.18
EBPL-206ENST00000473576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.18
EBPL-206ENST00000473576 CUX2O14529 1486 aa47.33■■■■■ 5.17
EBPL-206ENST00000473576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.3■■■■■ 5.16
EBPL-206ENST00000473576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.03■■■■■ 5.12
EBPL-206ENST00000473576 CFTRP13569 1480 aa47■■■■■ 5.11
EBPL-206ENST00000473576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
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EBPL-206ENST00000473576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.78■■■■■ 5.08
EBPL-206ENST00000473576 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.77■■■■■ 5.08
EBPL-206ENST00000473576 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.75■■■■■ 5.07
EBPL-206ENST00000473576 WDR62O43379 1518 aa46.62■■■■■ 5.05
EBPL-206ENST00000473576 PRDM2Q13029 1718 aa46.48■■■■■ 5.03
EBPL-206ENST00000473576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.4■■■■■ 5.02
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EBPL-206ENST00000473576 ABCC8Q09428 1581 aa46.05■■■■■ 4.96
EBPL-206ENST00000473576 TOPBP1Q92547 1522 aa45.98■■■■■ 4.95
EBPL-206ENST00000473576 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.88■■■■■ 4.94
EBPL-206ENST00000473576 IFT140Q96RY7 1462 aa45.83■■■■■ 4.93
EBPL-206ENST00000473576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
EBPL-206ENST00000473576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
EBPL-206ENST00000473576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
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EBPL-206ENST00000473576 SOGA1O94964 1423 aa45.43■■■■■ 4.86
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EBPL-206ENST00000473576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.36■■■■■ 4.85
EBPL-206ENST00000473576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
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EBPL-206ENST00000473576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
EBPL-206ENST00000473576 WDR97A6NE52 1622 aa45.16■■■■■ 4.82
EBPL-206ENST00000473576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.09■■■■■ 4.81
EBPL-206ENST00000473576 TOP2BQ02880 1626 aa44.98■■■■■ 4.79
EBPL-206ENST00000473576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.97■■■■■ 4.79
EBPL-206ENST00000473576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.96■■■■■ 4.79
EBPL-206ENST00000473576 GRIN2BQ13224 1484 aa44.92■■■■■ 4.78
EBPL-206ENST00000473576 SYNJ1O43426 1573 aa44.9■■■■■ 4.78
EBPL-206ENST00000473576 FBLN2P98095 1184 aa44.88■■■■■ 4.78
EBPL-206ENST00000473576 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.87■■■■■ 4.77
EBPL-206ENST00000473576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.85■■■■■ 4.77
EBPL-206ENST00000473576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
EBPL-206ENST00000473576 CHD1O14646 1710 aa44.82■■■■■ 4.77
EBPL-206ENST00000473576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
EBPL-206ENST00000473576 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.75■■■■■ 4.75
EBPL-206ENST00000473576 PBRM1Q86U86 1689 aa44.68■■■■■ 4.74
EBPL-206ENST00000473576 SYNJ2O15056 1496 aa44.67■■■■■ 4.74
EBPL-206ENST00000473576 TRIM41Q8WV44 630 aa44.61■■■■■ 4.73
EBPL-206ENST00000473576 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.53■■■■■ 4.72
EBPL-206ENST00000473576 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.53■■■■■ 4.72
EBPL-206ENST00000473576 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.53■■■■■ 4.72
EBPL-206ENST00000473576 ARHGEF11O15085 1522 aa44.52■■■■■ 4.72
EBPL-206ENST00000473576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.43■■■■■ 4.7
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EBPL-206ENST00000473576 KIF27Q86VH2 1401 aa44.21■■■■■ 4.67
EBPL-206ENST00000473576 NUP160Q12769 1436 aa44.16■■■■■ 4.66
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EBPL-206ENST00000473576 IGF1RP08069 1367 aa44.09■■■■■ 4.65
EBPL-206ENST00000473576 CEP170Q5SW79 1584 aa44.05■■■■■ 4.64
EBPL-206ENST00000473576 CUL7Q14999 1698 aa43.9■■■■■ 4.62
EBPL-206ENST00000473576 SHROOM2Q13796 1616 aa43.82■■■■■ 4.61
EBPL-206ENST00000473576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.81■■■■■ 4.6
EBPL-206ENST00000473576 JPH4Q96JJ6 628 aa43.79■■■■■ 4.6
EBPL-206ENST00000473576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.71■■■■■ 4.59
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