Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP5P51878 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP5P51878 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP5P51878 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP5P51878 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP5P51878 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP5P51878 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP5P51878 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP5P51878 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASP5P51878 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP5P51878 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASP5P51878 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP5P51878 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP5P51878 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP5P51878 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP5P51878 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP5P51878 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP5P51878 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASP5P51878 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP5P51878 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP5P51878 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP5P51878 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP5P51878 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP5P51878 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASP5P51878 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP5P51878 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP5P51878 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP5P51878 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP5P51878 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP5P51878 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASP5P51878 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASP5P51878 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP5P51878 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP5P51878 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP5P51878 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP5P51878 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP5P51878 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP5P51878 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP5P51878 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP5P51878 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP5P51878 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP5P51878 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASP5P51878 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP5P51878 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP5P51878 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP5P51878 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP5P51878 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP5P51878 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP5P51878 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASP5P51878 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP5P51878 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP5P51878 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP5P51878 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP5P51878 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP5P51878 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP5P51878 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP5P51878 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP5P51878 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP5P51878 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP5P51878 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP5P51878 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP5P51878 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP5P51878 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP5P51878 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP5P51878 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP5P51878 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP5P51878 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP5P51878 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP5P51878 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP5P51878 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms