Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IQGAP1P46940 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IQGAP1P46940 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IQGAP1P46940 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
IQGAP1P46940 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IQGAP1P46940 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IQGAP1P46940 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IQGAP1P46940 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
IQGAP1P46940 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
IQGAP1P46940 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IQGAP1P46940 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.82■■■■□ 3
IQGAP1P46940 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
IQGAP1P46940 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
IQGAP1P46940 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
IQGAP1P46940 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
IQGAP1P46940 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IQGAP1P46940 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.79■■■■□ 3
IQGAP1P46940 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
IQGAP1P46940 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
IQGAP1P46940 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
IQGAP1P46940 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
IQGAP1P46940 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.79■■■■□ 3
IQGAP1P46940 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
IQGAP1P46940 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IQGAP1P46940 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IQGAP1P46940 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IQGAP1P46940 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
IQGAP1P46940 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
IQGAP1P46940 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IQGAP1P46940 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
IQGAP1P46940 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
IQGAP1P46940 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
IQGAP1P46940 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IQGAP1P46940 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IQGAP1P46940 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms