Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSFMP43897 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSFMP43897 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSFMP43897 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSFMP43897 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSFMP43897 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSFMP43897 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSFMP43897 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSFMP43897 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSFMP43897 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSFMP43897 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSFMP43897 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSFMP43897 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSFMP43897 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSFMP43897 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSFMP43897 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSFMP43897 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSFMP43897 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSFMP43897 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSFMP43897 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSFMP43897 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TSFMP43897 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSFMP43897 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSFMP43897 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSFMP43897 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSFMP43897 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSFMP43897 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSFMP43897 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSFMP43897 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSFMP43897 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSFMP43897 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSFMP43897 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSFMP43897 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSFMP43897 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSFMP43897 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSFMP43897 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSFMP43897 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSFMP43897 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSFMP43897 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSFMP43897 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSFMP43897 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSFMP43897 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSFMP43897 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSFMP43897 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSFMP43897 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSFMP43897 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms