Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAGEA4P43358 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms