Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN7P41732 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN7P41732 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms