Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT2P35908 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT2P35908 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT2P35908 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT2P35908 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT2P35908 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT2P35908 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT2P35908 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT2P35908 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT2P35908 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT2P35908 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT2P35908 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT2P35908 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT2P35908 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT2P35908 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT2P35908 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT2P35908 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT2P35908 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT2P35908 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT2P35908 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT2P35908 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT2P35908 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT2P35908 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT2P35908 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT2P35908 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT2P35908 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT2P35908 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT2P35908 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT2P35908 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT2P35908 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT2P35908 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT2P35908 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT2P35908 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT2P35908 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT2P35908 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT2P35908 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT2P35908 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT2P35908 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT2P35908 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT2P35908 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT2P35908 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT2P35908 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT2P35908 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT2P35908 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT2P35908 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT2P35908 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT2P35908 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT2P35908 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT2P35908 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT2P35908 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT2P35908 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT2P35908 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT2P35908 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT2P35908 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT2P35908 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT2P35908 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT2P35908 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT2P35908 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT2P35908 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT2P35908 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT2P35908 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT2P35908 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT2P35908 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT2P35908 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT2P35908 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT2P35908 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT2P35908 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT2P35908 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT2P35908 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT2P35908 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms