Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC12P31275 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXC12P31275 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC12P31275 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms