Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5A1P25705 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5A1P25705 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms