Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VDAC1P21796 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VDAC1P21796 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VDAC1P21796 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms