Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCP20941 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCP20941 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCP20941 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCP20941 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCP20941 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCP20941 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCP20941 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCP20941 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCP20941 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCP20941 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCP20941 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCP20941 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCP20941 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCP20941 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCP20941 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCP20941 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCP20941 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCP20941 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCP20941 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCP20941 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCP20941 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCP20941 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCP20941 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCP20941 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCP20941 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCP20941 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCP20941 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCP20941 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCP20941 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCP20941 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCP20941 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCP20941 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCP20941 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCP20941 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCP20941 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCP20941 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCP20941 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCP20941 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms