Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA1P20827 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA1P20827 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms