Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SFTA3P0C7M3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTA3P0C7M3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTA3P0C7M3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms