Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT16P08779 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT16P08779 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT16P08779 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT16P08779 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT16P08779 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT16P08779 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT16P08779 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT16P08779 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT16P08779 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT16P08779 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT16P08779 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT16P08779 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT16P08779 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT16P08779 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT16P08779 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT16P08779 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT16P08779 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT16P08779 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT16P08779 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT16P08779 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT16P08779 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT16P08779 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT16P08779 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT16P08779 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT16P08779 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT16P08779 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT16P08779 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT16P08779 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT16P08779 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT16P08779 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT16P08779 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT16P08779 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT16P08779 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT16P08779 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT16P08779 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT16P08779 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT16P08779 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT16P08779 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT16P08779 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms