Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE2O96020 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE2O96020 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE2O96020 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms