Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6orf47O95873 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C6orf47O95873 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C6orf47O95873 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms