Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF3O75054 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF3O75054 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGSF3O75054 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF3O75054 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms