Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAPBPO15533 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAPBPO15533 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAPBPO15533 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms