Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC3O15379 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC3O15379 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC3O15379 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms