Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TO15178 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TO15178 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TO15178 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TO15178 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TO15178 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TO15178 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TO15178 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TO15178 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TO15178 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TO15178 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TO15178 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TO15178 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TO15178 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TO15178 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TO15178 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TO15178 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TO15178 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TO15178 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TO15178 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TO15178 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TO15178 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TO15178 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TO15178 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TO15178 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TO15178 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TO15178 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TO15178 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TO15178 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TO15178 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TO15178 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TO15178 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TO15178 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TO15178 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms