Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD12O00232 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD12O00232 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms