Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms