Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms