Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGB1P1B2RPK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGB1P1B2RPK0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGB1P1B2RPK0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms