Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6L4A6NEF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms