Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMCO3A2RU48 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMCO3A2RU48 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms