Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C9orf170A2RU37 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C9orf170A2RU37 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms