Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
U3KQE9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQE9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQE9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQE9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQE9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQE9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
U3KQE9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
U3KQE9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
U3KQE9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
U3KQE9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
U3KQE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
U3KQE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
U3KQE9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U3KQE9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
U3KQE9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U3KQE9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
U3KQE9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U3KQE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U3KQE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U3KQE9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U3KQE9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U3KQE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U3KQE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U3KQE9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
U3KQE9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U3KQE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U3KQE9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U3KQE9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U3KQE9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U3KQE9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U3KQE9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U3KQE9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U3KQE9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
U3KQE9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
U3KQE9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
U3KQE9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
U3KQE9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms