Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOD1Q9Y239 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOD1Q9Y239 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOD1Q9Y239 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms